forwarding to the list<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jun 26, 2012 at 3:35 AM, Fabian Glaser <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:fglaser@technion.ac.il" target="_blank">fglaser@technion.ac.il</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
I cannot compile grid on my Mac OSX, I tried both g77 and gfortran and the problems seems to be related to the architecture. Can grid be compiled into a 64 OSX machine?<br>
<br>
Here is the output I got:<br>
<br>
<br>
g77  -O2 -fno-automatic -fno-second-underscore grid.o score.o score_grid.o gridpoint.o define.o io.o io_grid.o io_gridf.o mol_prep.o io_receptor.o io_mol2.o io_pdb.o io_ptr.o io_sph.o label.o label_node.o label_chem.o label_vdw.o label_flex.o mol.o search.o transform.o transformf.o parm.o parm_grid.o rotrans.o utility.o vector.o -lm -lpthread -o grid \<br>


<br>
ld: warning: -macosx_version_min not specificed, assuming 10.7<br>
ld: warning: ignoring file grid.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file score.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file score_grid.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file define.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file io.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file io_grid.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file mol_prep.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file io_receptor.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file io_mol2.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file io_pdb.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file io_ptr.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file io_sph.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file label.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file label_node.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file label_chem.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file label_vdw.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file label_flex.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file mol.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file search.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file transform.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file parm.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file parm_grid.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file rotrans.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file utility.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
ld: warning: ignoring file vector.o, file was built for unsupported file format which is not the architecture being linked (i386)<br>
Undefined symbols for architecture i386:<br>
  &quot;_MAIN__&quot;, referenced from:<br>
      _main in libfrtbegin.a(frtbegin.o)<br>
ld: symbol(s) not found for architecture i386<br>
collect2: ld returned 1 exit status<br>
make: *** [grid] Error 1<br>
<br>
<br>
Thanks!!<br>
<br>
Fabian<br>
______________________________<br>
Fabian Glaser, PhD<br>
Bioinformatics Knowledge Unit,<br>
The Lorry I. Lokey Interdisciplinary<br>
Center for Life Sciences and Engineering<br>
Technion - Israel Institute of Technology<br>
Haifa 32000, ISRAEL<br>
E-mail: <a href="mailto:fglaser@technion.ac.il">fglaser@technion.ac.il</a><br>
Tel:    <a href="tel:%2B972-4-8293701" value="+97248293701">+972-4-8293701</a><br>
Fax:   <a href="tel:%2B972-4-8225153" value="+97248225153">+972-4-8225153</a><br>
<br>
On Jun 25, 2012, at 7:29 PM, <a href="mailto:dock_license@dock.compbio.ucsf.edu">dock_license@dock.compbio.ucsf.edu</a> wrote:<br>
<br>
&gt; Dear DOCK User,<br>
&gt;<br>
&gt;  You have been issued another DOCK 6 password.  Please go to the following link<br>
&gt; for downloading instructions.<br>
&gt;<br>
&gt; <a href="https://dock.compbio.ucsf.edu/retrieve_dock_distribution.html" target="_blank">https://dock.compbio.ucsf.edu/retrieve_dock_distribution.html</a><br>
&gt;<br>
&gt;       Login: <a href="mailto:fglaser@technion.ac.il">fglaser@technion.ac.il</a><br>
&gt;       Password: vmQtFMkjdGfwCyd<br>
&gt;<br>
&gt; You will be given FIVE opportunities to download DOCK, after which the<br>
&gt; password will expire.  If you need additional access to the software, please<br>
&gt; contact the license administrator at <a href="mailto:dock_license@dock.compbio.ucsf.edu">dock_license@dock.compbio.ucsf.edu</a>.<br>
&gt;<br>
&gt; Sincerely,<br>
&gt;<br>
&gt; The DOCK Team<br>
<br>
</blockquote></div><br>