<div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>I&#39;m guessing that this may be some sort of input error or something simple. </div><div><br></div><div>I compiled dock6 and dock6.mpi without any real problems.  the path to mpirun is correct, all the other paths seem to be correct. </div><div><br></div><div>When I run a basic screen on a set of compounds using the serial version or using the mpi version, dock is taking the exact amount of time. I would have to believe if I am looking at 100 compounds using 48 cpu&#39;s, that I would see some sort of speed increase. </div><div><br></div><div>The only other thing that I can think of is that the cluster we have has been set up using openmpi-1.8.5.  However, I installed and compiled against a local version of mpich-3.1.4 and I&#39;m executing it from the full path.</div><div><br></div><div>I was wondering if anyone has any other advice on trouble shooting this.</div><div><br></div><div>Thanks.</div><div>Jonathan</div></div>