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<p><span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;">Hello,</span><br>
</p>
<p><span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;">I&#8217;ve tried using rigid and flexible docking to dock a molecule containing a cis c-c double bond. After running the dock the conformation of the bond turns into trans? Please do you know of&nbsp;any solution
 to correct this?&nbsp;</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;">Thanks,</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;">Jim</span><br>
</p>
</div>
<br>
<span style="font-size:10pt;">The University of Dundee is a registered Scottish Charity, No: SC015096</span>
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